「モンスターハンタークロス」からの引き継ぎは、何度でもできますか?

はい。可能です。
ただし、引き継ぎをやり直す場合は、「モンスターハンターダブルクロス」のセーブデータを削除する必要があります。
「ゲームモードの選択」画面から「OPTIONS」を選び、「セーブデータの初期化」を選択することで、SDカード内のセーブデータを削除することができます。
なお、「モンスターハンターダブルクロス」の「追加データ」の中には製品版のセーブデータと体験版のセーブデータの両方が保存されます。
「追加データ」の削除を行った場合と、製品版で「セーブデータの初期化」を行った場合では、以下の違いがあります。
●本体のホームメニューから「追加データ」を削除した場合
製品版のセーブデータと体験版のセーブデータが両方削除されます。
【手順】
本体のホームメニューから「本体設定」>「データ管理」>「ニンテンドー3DS データ管理」>「追加データ管理」で「モンスターハンターダブルクロス」の「追加データ」を削除
●製品版の「OPTIONS」から「セーブデータの初期化」を選択した場合
「追加データ」は削除されず、製品版のセーブデータのみ削除されます(体験版のセーブデータは残ります)。
【手順】
ゲーム起動後「ゲームモードの選択」画面の「OPTIONS」から「セーブデータの初期化」を選択