「ロックマンゼロ1～4」「ロックマン ゼクス／ゼクス アドベント」のシナリオなど基本的なゲーム内容は、過去に発売されたものと同様ですが、本作では以下の新要素が追加されています。

・新ゲームモード「Zチェイサー」
・カジュアルシナリオモード
・アシストセーブ
・高画質フィルター
・画面レイアウト
・ギャラリー
・ミュージックプレイヤー
・ボーナスカード
・ゼロ3 プラスモード/ゼロ4 プラスモード

詳細は、「ロックマン ゼロ&ゼクス ダブルヒーローコレクション」公式サイトをご確認ください。

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