「ロックマンエグゼ オペレートシューティングスター」ではゲームクリア後に"つづきから"を選択し、ゲームをスタートすると、ゲーム中最後にセーブした地点から始まる仕様となっております。

クリア後に表示されるメッセージ"さいごにセーブしたデータをよみこんでクリアじょうほうをかきこみますか"で「はい」を選択していれば、一度シナリオをクリアしたという事はゲーム内には反映されております（タイトル画面"つづきから"の横にマークが追加されます）ので、クリア前にはバトルできなかったナビが出現したり、行く事ができなかったエリアに行くことが可能となります。