いいえ。
ゲームのシステムやプレイできるモードなど、基本的なゲーム内容に違いはありません。
ただし、アップグレード版をご利用の場合、タイトル画面やオープニングムービーでは現在使用されているゲームディスク「スーパーストリートファイターIV」もしくは「スーパーストリートファイターIVアーケードエディション」の内容が表示されます。

※アップグレード版をプレイするには、「スーパーストリートファイターIV」もしくは、「スーパーストリートファイターIV アーケードエディション」のゲームディスクが必要です。