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ロックマンの活躍によってDr.ワイリーもとうとう逮捕され、再び全世界に平和な日々が訪れた。
しかし、彼は万が一捕らえられた時に、自分を救出するように4体の戦闘ロボットを研究所内に隠していたのだ。
数か月後、戦闘ロボットたちは刑務所の襲撃と、付近一帯の都市の制圧を開始。Dr.ワイリーは、嘲笑とともに大空の彼方に消えていった…。
街に、そして世界に平和を取り戻せ!!

ゾンビや幽霊型のロボットが多く登場するステージ。隠しコマンドを入力すると、BGMが『魔界村』に！

シェードマン

ステージにはいたるところにバネが配置。足元をすくわれないよう落下に注意しながら進もう！

スプリングマン

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宇宙から落下した謎の隕石を調査に向かったロックマン。
しかし、そこにはワイリーがやって来ていた。
巨大な力を秘めた悪のエネルギーを軸に、宇宙から落ちてきた謎のロボットのデューオとワイリーの野望をめぐる戦いが繰り広げられる！

スノーボードでは、迫りくる敵や落下ポイントを瞬時に見極める必要がある難関ステージ。

フロストマン

上下にも広がる密林地帯。思わぬところにアイテムが配置されていたりするのでくまなく探検しよう。

サーチマン

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ある日世界中でロボットが暴れだし、混乱が訪れる。
誰もがまたワイリー博士の仕業だと思ったが、なんと暴れているロボットの製作者はライト博士であることが判明！
同時にワイリー博士の証言により、ライト博士が世界征服をほのめかしていたことが伝えられ、研究所に抗議が殺到する。
ロックマンはライト博士の汚名返上のため、暴れているロボットを止めに再び立ち上がるのだった。

雪や雨など気象が様々に変化する空中ステージ。

トルネードマン

特定の場所に出入りするワープホール。焦らずパターンをつかみながら慎重に進もう。

ギャラクシーマン

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20XX年。ロボットエンザ（ロボット風邪）が発生。ロボットエンザはまたたく間に世界中に拡がり、多くのロボットが倒れてしまった。
そして発生から1ヶ月後。感染によって熱暴走したロボットたちが街を破壊し、各地を占拠！
そんな折にライト博士らのもとにDr.ワイリーがやって来た。治療に必要なロボットワクチンの製造機を暴走したロボットたちに持ち去られてしまったらしい。
それを聞いたロックマンは、世界の危機を救うため、製造機を取り戻すべく立ち上がるのだった。

敵や飛び交う炎の配置に苦戦を強いられる厄介なステージ。炎をタイミング良くくぐって進もう。

ソーラーマン

一定時間ごとに襲ってくる砂嵐に注意！
視界を奪われるので安全な場所に避難しよう。

コマンドマン